Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmco5aQ9D9D5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms