Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi35Q9D8C4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 440.5 ms