Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem54Q9D7S1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem54Q9D7S1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.7 ms