Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb11Q9D6H2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb11Q9D6H2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb11Q9D6H2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms