Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PudpQ9D5U5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288 ms