Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms