Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms