Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930578G10RikQ9D4Q4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms