Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul2Q9D4H8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul2Q9D4H8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul2Q9D4H8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms