Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms