Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Snrnp35Q9D384 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms