Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem53Q9D0Z3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem53Q9D0Z3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms