Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms