Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrs1Q9CYH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrs1Q9CYH6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms