Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Nip7Q9CXK8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms