Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm8aQ9CWZ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm8aQ9CWZ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms