Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx10Q9CWT3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 696.4 ms