Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930553M12RikQ9CUH1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930553M12RikQ9CUH1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms