Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras2Q9CR56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms