Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FanclQ9CR14 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FanclQ9CR14 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FanclQ9CR14 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms