Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop4Q9CR08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms