Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Riok2Q9CQS5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Riok2Q9CQS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Riok2Q9CQS5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok2Q9CQS5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riok2Q9CQS5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms