Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nicn1Q9CQM0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nicn1Q9CQM0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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