Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rwdd1Q9CQK7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms