Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ergic3Q9CQE7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ergic3Q9CQE7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms