Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpa3Q9CQ71 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms