Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npm3Q9CPP0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Npm3Q9CPP0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms