Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3CQ9BUI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3CQ9BUI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3CQ9BUI4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms