Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac9Q99N13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms