Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja3Q99M87 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja3Q99M87 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja3Q99M87 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms