Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clint1Q99KN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms