Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pls3Q99K51 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms