Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrabdQ99JY4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrabdQ99JY4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms