Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl22Q99JN2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl22Q99JN2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl22Q99JN2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl22Q99JN2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl22Q99JN2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl22Q99JN2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl22Q99JN2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms