Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apobec3Q99J72 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec3Q99J72 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms