Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrbp1Q99J45 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrbp1Q99J45 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms