Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms