Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms