Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1bQ920F6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1bQ920F6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms