Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZB0

Alpk2, Alpha-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk2Q91ZB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk2Q91ZB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Alpk2Q91ZB0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms