Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chrna2Q91X60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna2Q91X60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna2Q91X60 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms