Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp6Q91WS2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrp6Q91WS2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms