Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csde1Q91W50 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms