Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms