Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx7Q8VDS3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms