Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf1Q8VDF2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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