Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stn1Q8K2X3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms