Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paf1Q8K2T8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paf1Q8K2T8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paf1Q8K2T8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms