Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf3Q8K268 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf3Q8K268 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms