Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Znf628Q8CJ78 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf628Q8CJ78 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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